Genetic Similarity in Crucian Carp(Carassius carassius) by PCR-RAPD Analysis

• 영문명: Genetic Similarity in Crucian Carp(Carassius carassius) by PCR-RAPD Analysis
• 발행기관: 군산대학교 수산과학연구소
• 저자명: 윤종만(Jong-Man Yoon) 김종연(Jong-Yeon Kim)
• 간행물 정보: 『군산대학교 수산과학연구소 연구논문집』제5집, 42~49쪽, 전체 8쪽
• 주제분류: 농수해양 > 해양학
• 파일형태: PDF
• 발행일자: 2004.07.03

국문 초록

군산지역에 있는 호수와 양식장에서 채집된 용어 (Carassius carassius)의 혈액으로부터 추출된 genomic DNA를 무작위 primer를 이용한 PCR-RAPD 방법에 의해서 유전적 차이를 확인하고자 하였다 . 12개 primer 중에서 6개를 이용한 결과 호수산 붕어의 경우 primer 당 약 2.1 polymorphic bands가 나타났고, 총 266개의 높은 RAPD marker가 확인되었으며; 0.18에서 0.76의 band sharing 분석 결과가 나타났다. 군산지역에 있는 호수와 양식장에서 채취된 붕어 2집단 간의 RAPD특정을 band sharing value로 비교 분석해 본 결과 각각 호수 산이 0.47, 양식산이 0.70으로 나타났으며, 이는 양식산 개체들 간에 유사성이 높게 나타났다. 이러한 결과는 군산지역에 있는 양식장의 경우 유사한 환경조건 내에서 붕어가 사육되었거나 혹은 오랜 기간 동안 근친교배의 결과 이러한 유전적 유사성이 높게 나타난 것으로 사료된다. 달리 말하면 비록 다양한 지리적 인 분포가 있더라도 군산지역의 다른 지역으로부터 야생산 붕어 집단의 도입으로 인하여 genomic DNA 의 높은 수준의 다양성을 가질 수 있다는 것이다 일반적으로 primer에 의해서 제시된 RAPD 다형성은 양식대상 어종이연서 온수성 어종인 붕어의 계통 혹은 집단을 확인하기 위한 유전적 표지인자로서 사용될 수 있을 것이다 그러나 앞으로 집단 및 채집 장소의 추가적인 확보 그러고 다른 방법을 통한 연구가 미비한 점을 보완할 수 있는데 필요하다고 사료된다.

영문 초록

Genomic DNA from the blood of crucian carp( Carassius corassius) from lake and aquaculture facility in Kunsan, Korea was extracted in order to identify genetic differences by polymerase chain reaction-randomly amplified polymorphic DNAs(PCR-RAPD). Out of 12 primers, 6 generated 266 highly reproducible RAPD markers. producing approximately 2.1 polymorphic bands per primer in crucian carp from lake. The degree of similarity varied from 0.18 to 0.76 as calculated by band sharing analysis in crucian carp from lake. The RAPD outlines obtained with DNA of two different crucian carp populations from Kunsan were different(0.47 from lake and 0.70 from aquaculture facility. respectively). The electrophoretic analysis of polymerase chain reaction-randomly amplified polymorphic DNAs(PCR-RAPD) products showed high levels of similarity between different individuals in crucian carp from aquaculture facility. This result implies the genetic similarity due to raising in the same environmental condition or inbreeding within the crucian carp from aquaculture facility in Kunsan. In other words. crucian carp may have high levels of genome DNA diversity due to the introduction of the wild population from the other sites of Kunsan even if it may be the geographical diverse distribution of this species. Generally. the RAPD polymorphism generated by these primers may be useful as a genetic marker for strain or population identification of important aquacultral lish species. crucian carp. However. in future. additional populations and sampling sites will be necessary to complement weak points.

목차

ABSTRACT

요약

INTRODUCTION

MATERIALS AND METHODS

RESULTS

DISCUSSION

ACKNOWLEDGEMENTS

REFERENCES