본 연구소는 수산과 양식에 관련된 기초학문 연구와 기술개발 및 보급을 위하여 설립된 연구소로 국제화 와 WTO 체제하의 신해양 질서에 따른 경쟁력 있는 수산산업 발전에 선도적 역할을 목적으로 한다.