단백질 전기영동 분석을 위한 포인트 매칭 알고리즘에 관한 연구

• 영문명: Review of Algorithms for Analyzing Protein Spots in 2-DE
• 발행기관: 한국의료정보교육협회
• 저자명: 류윤규(Yun-Kyoo Ryoo)
• 간행물 정보: 『보건의료생명과학논문지』Vol.6 No.2, 143~149쪽, 전체 7쪽
• 주제분류: 의약학 > 의학일반
• 파일형태: PDF
• 발행일자: 2018.12.30

국문 초록

단백질 2차원 전기영동은 포스트 게놈 시대의 주목받는 기술이다. 유전자 서열이 해독되면서 생명현상의 비밀이 모두 밝혀질 수 있을 것이라는 예상은 빗나갔다. 생명현상을 이해하기 위해서는 유전자가 단백질을 어떻게 만들어내는지를 이해할 필요가 있다는 것이 판명되었다. 이러한 필요에 따라 단백질 2차원 전기영동 기술이 출현하였다. 단백질 2차원 전기영동은 단백질이 가진 전기적인 특성과 분자량을 이용하여 이동이 자유로운 젤리형태의 겔판 상에 단백질을 2차원적으로 분리하는 기술이다. 모든 단백질은 이러한 고유한 특성 때문에 고유한 2차원적인 위치로 분리된다. 이러한 2차원적인 위치가 단백질을 식별하는 중요한 단서가 된다. 그러나 단백질 2차원 전기영동은 다양한 변이가 포함되는 특성이 있어 컴퓨터 영상 기술을 이용한 단백질 판별이 매우 어려운 분야이다. 따라서 연구자들은 다년간에 걸쳐 단백질 2차원 전기영동에서 참조 겔과 목적 겔을 포인트 레벨에서 비교하여 단백질을 식별하는 일련의 연구들을 진행하였다. 본 논문에서는 단백질 2차원 전기영동에서 단백질을 식별하는 연구결과를 정리하여 연구의 방향과 흐름을 비교하고 어떠한 연구들이 진행되었고 개별 논문들이 단백질 판별에서 가지는 의의를 설명한다.

영문 초록

Protein two-dimensional electrophoresis(2-DE) is a notable technology in the post genome era. As the gene sequence was deciphered, the expectation that all the secrets of life phenomena could be found was missed. To understand the phenomena of life, it was necessary to understand how genes make proteins. Protein two-dimensional electrophoresis technology emerged as needed. Protein Two-dimensional electrophoresis is a technique of two-dimensionally spreading proteins on a jelly-shaped gel plate that is free to move using the electrical properties and molecular weight of proteins. All of the proteins are separated into their unique two-dimensional positions due to these inherent characteristics. This two-dimensional location is an important clue for identifying proteins. However, protein two-dimensional electrophoresis is characterized by a myriad of mutations, making it difficult to distinguish proteins using computerized imaging techniques. The researchers continued to study a series of research to identify proteins by comparing the reference gel and the target gel at point level in protein two-dimensional electrophoresis for many years. In this paper, we summarize the results of protein identification in protein two - dimensional electrophoresis, so that we can understand the direction and flow of the study.

목차

1. 서론

2. 관련연구

3.전기영동이미지분석을위한알고리즘

4. 결론

References

키워드

Point Matching Algorithm 5-NNG 2-DE Grassfire Spot Matching Reference gel Target gel