ChEMBL 데이터베이스 선별에 의한 코로나 바이러스 표적 화합물

Motonori Tsuji 지음

아진 2020년 06월 17일 출간

작품소개

책소개

초 록(Abstract)

A novel coronavirus [severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
(SARS-CoV-2), or 2019 novel coronavirus] has been identified as the pathogen of
coronavirus disease 2019. The main protease(Mpro, also called 3-chymotrypsin-like
protease) of SARS-CoV-2 is a potential target for treatment of COVID-19. A Mpro
homodimer structure suitable for docking simulations was prepared using a crystal
structure (PDB ID: 6Y2G; resolution 2.20 A). Structural refinement was performed
in the presence of peptidomimetic a-ketoamide inhibitors, which were previously
disconnected from each Cys145 of the Mpro homodimer, and energy calculations
were performed. Structure-based virtual screenings were performed using the
ChEMBL database. Through a total of 1 485 144 screenings, 64 potential drugs (11
approved, 14 clinical, and 39 preclinical drugs) were predicted to show high binding
affinity with Mpro. Additional docking simulations for predicted compounds with
high binding affinity with Mpro suggested that 28 bioactive compounds may have
potential as effective anti-SARS-CoV-2 drug candidates. The procedure used in
this study is a possible strategy for discovering anti-SARS-CoV-2 drugs from
drug libraries that may significantly shorten the clinical development period with
regard to drug repositioning.
등록상표
표지 및

목차

제 1편 코로나바이러스 정의
1. 코로나바이러스감염증-19(Covid-19) 정보 7
2. 코로나바이러스 분류 및 특성 9
3. 코로나 바이러스 전자현미경 형태 11
4. 코로나바이러스 구조 (Covid-19 Organization) 13
5. 코로나19: 환경에 지속적인 영향을 미칠까? 19
6. 치료법(Therapeutical Method) 22

제 2편 연구논문
Potential anti-SARS-CoV-2 drug candidates identified through virtual
screening of the ChEMBL database for compounds that target the
main coronavirus protease

1. Abstract 23
2. Introduction 23
3. Methods 24
4. Preparation of 3D structures from the ChEMBL database 24
5. Additional docking simulations for hit compounds 25
6. Results and Discussion 25
7. Conclusions 31
8. References 31

출판사 서평

들어가기 전

신종 코로나19가 팬데믹으로 선언되면서 단순한 전염병의 수준을 넘어 전 세계적인 혼
란과 동시에 세계 곳곳에서 인간의 본질적인 삶을 위협하고 있습니다.
본 내용은 세계 석학들의 연구 논문 중에서 COVID-19 관련 논문을 찾아 발간하게 되
었습니다.
논문에 이해를 돕기위하여, 코로나19에 대한 내용을 게재하였습니다. 본 내용은 관련
논문 내용과 관련은 없습니다.
전 세계 과학자들은 코로나19에 대한 연구와 분석을 재빠르게 진행하고 있습니다. 지금
이 순간에도 2019-nCoV의 유전체분석, 표면 단백질 구조 및 생물학적 특성, 전파경
로, 숙주의 증상, 신약개발, 사회경제적 현상, 환경적인 요인 등 다양한 분야에서 의미
있는 연구결과를 내놓고 있습니다.
세계 모든 석학분들 및 연구자 분들에게 감사의 뜻을 전달 합니다.
인류에게 닥친 이 위기를 현명하게 극복하기를 바라며, 하루 빨리 코로나19가 종식되기
를 희망합니다.

작가정보

저자(글) Motonori Tsuji