본 연구소는 진리와 자유와 사랑의 이념을 바탕으로 복음의 진리를 한국 사회와 세계 속에 구현하는 것을 목적으로 한다. 한국 신학의 산실이 되어 온 『신학사상』의 창간 정신을 오늘에 살리고 더욱 발전시키기 위하여 다음과 같은 과제를 목표로 한다. 첫째, 신학을 타학문, 타종교, 다른 사상들과 대화의 장으로 이끄는 학제간 연구와 에큐메니칼 신학을 창출한다. 둘째, 한국의 신학을 정초하고 세계에 알리며, 세계 신학을 한국에 알리며 대화한다. 셋째, 신학을 상아탑의 영역에 한정시키지 않고, 한국 사회의 정치, 경제, 사회, 문화적 과제를 연구하고 통일을 전망하는 실천적 신학운동이 되게 한다.