삼육대학교 신학연구소(神學硏究所)는 창조적이고 미래 지향적 기독교 세계관을 확립하여 사회 전반으로 확산시키기 위하여, 기독교 세계관에 기초하여 열린 자세로 융복합적인 진리 세계를 탐구하고, 미래 지향적인 새로운 기독교 문화를 한국 사회 전반에 널리 펼쳐 나가고자 한다. 이를 위해 본 연구소는 정기적으로 "신학과 학문"(1년에 3번)을 발간하고, 기타 수시로 신학 서적을 발간한다. 또한 각종 세미나 및 심포지엄을 개최하여 한국 사회에 건전한 기독교 문화 창출에 이바지하고자 한다.