서울대학교 교육종합연구원은 각 분야의 교과 교육을 서로 유기적인 관력 속에서 보다 심도있게 연구하고, 나아가 이를 토대로 우리나라 교육현실에 기여할 수 있는 실천적인 교육 프로그램을 개발하는 연구기관이다. 사범대학 내 기존 연구소들을 통합하여 1997년 설립된 종합연구 기관이며, 초기에는 외국어교육연구소, 사회교육연구소, 과학교육연구소, 특수교육연구소로 시작하였다. 이후, 과학영재교육센터(1998), 평생교육연구센터(2005), 다문화교육연구센터(2007), 인성교육연구센터(2009), 교육정책연구센터(2011년), 수학교육센터(2011), 통일교육연구센터(2014), 재외동포교육지원연구센터(2016), 미래교육혁신센터(2017)의 산하 연구소를 추가하여 다양한 교육 분야의 연구에 몰두하고 실천적인 교육 프로그램 개발에 매진하고 있다.