이 학회는 사회일반의 이익에 공여하기 위하여 민법 제32조 및 공익법인의 설립·운영에 관한 법률의 규정에 따라 구조생물학의 학술발전 및보급에 기여함으로써 과학과 기술의 진흥 및 인류 건강 증진에 이바지함을 목적으로 한다.