한국상고사학회는 1987년 가을 고고학과 고대사 등 한국상고사를 연구하는 여러 분야의 소장학자들이 중심이 되어 출발하였다. 본 학회의 설립 취지는 고고학, 고대사뿐만 아니라 자연과학 등 여러 분야 간의 학제적인 연구를 통해 한국상고사를 연구하기 위함을 목적으로 한다.