R & Meta-DiSc 진단검사 메타분석 (Diagnostic Test Accuracy using R & Meta-DiSc software)

이젠 R아야 한다 시리즈 ③

심성률 지음

에스디비연구소 2019년 03월 01일 출간

작품소개

책소개

메타분석은(meta-analysis)은 선행연구들의 결과를 추출한 후 이들을 수렴하여 계량적으로 통합하는 연구방법(research synthesis)의 하나로서 심리학, 교육학, 사회복지학 등 사회과학 분야뿐만 아니라 의학, 간호학, 보건학 등 의과학분야에서도 매우 활발하게 사용되고 있다.
특히 의료분야에서의 메타분석은 보건의료 전문가가 의사결정시 근거-기반 의학(evidence-based medicine)을 제공할 수 있다는 것이며 이를 통해 전문가 본인의 전문적 내적 지식과 다른 연구자들의 연구결과인 외적 근거들을 종합해 합리적인 의사결정을 이끌어 낼 수 있다.

본서의 특징은 다음과 같다.
첫째 진단검사 메타분석의 기초를 탄탄히 다질 수 있다.
둘째 진단검사 메타분석 방법론을 보건의료 연구에 직접 활용하기 위해 통계전문 소프트웨어인 R과 Meta-DiSc를 익히고 실습한다. 현재까지 두 프로그램을 아우르는 책은 본서가 유일하다.
따라서 책의 예제를 그대로 따라하기만 한다면 복잡해 보이고 전문적인 지식이 필요해 보이는 진단검사 메타분석을 누구나 간단히 재현해 낼 수 있을 것이다.

목차

1. 진단검사 메타분석의 이해
1.1. 진단검사 요약추정치
1.2. 진단검사 메타분석 모형
1.3. 효과크기 계산

2. R의 “mada” & “meta” 패키지를 이용한 진단검사 메타분석
2.1. 데이터 코딩 및 불러오기
2.2. 요약추정치
1) 단변량 분석 (Univariate analysis)
2) 이변량 분석 (Bivariate analysis)

3. Meta-DiSc를 이용한 이용한 진단검사 메타분석
3.1. 데이터 코딩 및 불러오기
3.2. 요약추정치
1) 단변량 분석 (Univariate analysis)
2) 이변량 분석 (Bivariate analysis)
4. 맺음말

참고문헌

Appendix. R 진단검사 메타분석 코드
R의 “mada” & “meta” 패키지를 이용한 진단검사 메타분석
▶ Descriptive statistics; Univariate analysis
▶ Descriptive statistics; bivariate analysis

책 속으로

『이젠 R아야 한다』시리즈를 기획하게 된 동기는 무료이면서도 강력한 통계기능들을 수행할 수 있는 R을 더 이상 외면할 수 없었기 때문이며 누구나 쉽게 메타분석에 접근하도록 도움을 주고자 하는 저자의 연구사명과도 일치한다.

물론 저자가 생각하는 가장 최적의 메타분석 소프트웨어는 STATA이다. 아마도 STATA와 R 소프트웨어를 경험한 연구자라면 누구나 쉽게 동의할 것이다. 예를 들어 동일한 메타분석을 수행하더라도 STATA에서는 단 한 줄의 명령어가 R에서는 명령어 문법을 이해해야 하며 여러 줄로 나누어야 한다. 그러나 무료이면서 강력한 통계기능은 충분히 이런 번거로움을 감내할 만하다.
또한 최근에는 R이 통계프로그램의 주류로 자리잡고 있으며 그 기능 측면에서 보자면 기존 상용프로그램들이 살아 남을 수 있을까 하는 의문이 들만큼 강력하다.
R을 이용하기 위해서는 기본적으로 R의 언어를 이해하여야 한다. 그러나 통계 분석용으로서의 R은 기초적인 패키지 사용과 데이터 및 함수 설정 방법 정도만 익힌다면 누구라도 쉽게 이용할 수 있다. 더욱이 R studio를 같이 설치한다면 그래픽 사용자 입력방식을 지원하기에 매우 편리하다.
진단검사 메타분석에서의 R은 솔직히 너무 불편하다. 연구자를 위한 것이 아니라 개발자를 위한 패키지 같다. 그래서 가장 간단하고 무료인 Meta-DiSc 프로그램의 사용법을 같이 넣어서 서로 비교할 수 있도록 편집하였다.
R로서 진단검사 메타분석을 실행하려면 마지막 부록의 R코드를 복사해서 R프로그램에서 그대로 붙인 다음 실행해 볼 것을 저자는 매우 권고한다. R에 대한 이해가 전혀 없더라도 막상 도출되는 결과가 눈에 보인다면 그때부터 본문의 내용을 따라가면서 하나씩 해석하면 될 것이다.

출판사 서평

『이젠 R아야 한다』 메타분석 시리즈는 저자 심성률 박사가 그동안 출판한 국내 연구자들을 위한 메타분석 방법론들을 묶어서 R 소프트웨어로 다시 풀어낸 것이다.

통계프로그램으로서의 R이 대세인 연구환경에서 R을 활용한 체계적인 메타분석 안내서가 요구되어지며 본서가 이에 대한 좋은 해답이 될 것임을 확신한다.
더욱이 R을 활용하여 기본적인 중재 메타분석 뿐만 아니라 Special topic인 네트워크 메타분석, 진단검사 메타분석, 용량-반응 메타분석 등을 상세히 안내하는 『이젠 R아야 한다』 메타분석 시리즈는 본서가 유일하다.
이론과 더불어 실습위주의 내용으로 이루어져 있어 통계학을 전공하지 않은 국내연구자들이 쉽고 빠르게 응용할 수 있을 것이다. 단계별로 예제를 따라가다보면 복잡하고 어려웠던 메타분석의 결과물이 도출되어져 있을 것이다.
마지막으로 본서는 가격적인 측면에서 상업용 책이라고 보기에는 민망하다. 그저 저자의 연구사명대로 누구나 쉽게 메타분석에 접근하도록 도움을 주고자하는 노력의 일환으로 바라봐 주기 바란다.

작가정보

저자(글) 심성률

저자 심성률은 고려대학교에서 역학 및 의료정보학을 전공하여 보건학 박사학위를 받았다(M.P.H. & PH.D.). 식품의약품 안전처와 식품의약품 안전평가원에서 메타분석과 위해도 평가 자문위원을 역임했다. 서울대학교 외 여러 기관에서 통계학(메타분석) 특강을 진행했으며 주요 SCI(E) 저널 논문 심사위원을 지냈다. 현재 고려대학교 의과대학 예방의학교실 겸임교수 및 순천향대학교 서울병원 비뇨의과학연구소 연구원으로 활동 중이다. 주요 저서로는 『메타분석 (forest plot에서 네트워크 메타분석까지)』 황성동·심성률 (2018) 한나래출판사. 『R 중재 메타분석 (Intervention meta-analysis using R software)』 심성률 (2019) 에스디비연구소(SDB Lab). 『R & Meta-DiSc 진단검사 메타분석 (Diagnostic Test Accuracy using R & Meta-DiSc software)』 심성률 (2019) 에스디비연구소(SDB Lab). 『R 용량-반응 메타분석 (Dose response meta-analysis using R software)』 심성률 (2019) 에스디비연구소(SDB Lab). 『R 네트워크 메타분석 (Network meta-analysis using R software; Bayesian & Frequentist approach)』 심성률 (2019) 에스디비연구소(SDB Lab). 『임상자료와 약물유전체 상관성 검증을 위한 근거기반 메타분석 안내서』 신인수·배종면·심성률 (2017) 식품의약품안전평가원 등이 있다. 주요 논문으로는 SCI(E) paper (약 30편 中 메타분석 16편)와 더불어 국내연구자를 위한 메타분석 방법론 5편 『중재 메타분석을 위한 STATA 명령어』 Journal of Health Informatics and Statistics. 『STATA를 이용한 진단검사 정확도 메타분석』 보건정보통계학회지. 『STATA 명령문을 이용한 용량-반응 메타분석』 Journal of Health Informatics and Statistics. 『네트워크 메타분석: STATA를 활용한 적용과 실제』 Epidemiology and Health. 『유전체 연관 환자-대조군 연구의 메타분석: 적용과 실제』 Epidemiology and Health. 『Efficacy and safety of prostatic arterial embolization: Systematic review with meta-analysis and meta-regression』 Journal of Urology. 『Diagnostic performance of PET in thyroid cancer with elevated anti-Tg Ab』 Endocrine-Related Cancer 등이 있다.