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R 네트워크 메타분석 (Network meta-analysis using R software; Bayesian & Frequentist approach)

이젠 R아야 한다 시리즈 ②
심성률 지음
에스디비연구소

2019년 03월 01일 출간

(개의 리뷰)
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eBook 상품 정보
파일 정보 pdf (3.62MB)
ISBN 9791196593315
쪽수 88쪽
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작품소개

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메타분석은(meta-analysis)은 선행연구들의 결과를 추출한 후 이들을 수렴하여 계량적으로 통합하는 연구방법(research synthesis)의 하나로서 심리학, 교육학, 사회복지학 등 사회과학 분야뿐만 아니라 의학, 간호학, 보건학 등 의과학분야에서도 매우 활발하게 사용되고 있다.
특히 의료분야에서의 메타분석은 보건의료 전문가가 의사결정시 근거-기반 의학(evidence-based medicine)을 제공할 수 있다는 것이며 이를 통해 전문가 본인의 전문적 내적 지식과 다른 연구자들의 연구결과인 외적 근거들을 종합해 합리적인 의사결정을 이끌어 낼 수 있다.

본서의 특징은 다음과 같다.
첫째 네트워크 메타분석의 전반적인 개념을 베이지안 방법과 빈도주의적 방법 모두를 이해할 수 있다. 현재까지 이를 모두 아우르는 책은 본서가 유일하다.
둘째 네트워크 메타분석 방법론을 보건의료 연구에 직접 활용하기 위해 통계전문 소프트웨어인 R을 익히고 실습한다.
따라서 책의 예제를 그대로 따라하기만 한다면 복잡해 보이고 전문적인 지식이 필요해 보이는 네트워크 메타분석을 누구나 간단히 재현해 낼 수 있을 것이다.
1. 네트워크 메타분석의 이해
1.1. 네트워크 메타분석의 통계적 접근
1) 베이지안 통계학
2) 마르코프연쇄 몬테카를로(Markov Chain Monte Carlo, MCMC) 시뮬레이션
3) 베이지안의 계층적 모형
1.2. 네트워크 메타분석의 기본원리
1) 간접비교
2) 혼합비교
1.3. 네트워크 메타분석의 가정
1) 유사성
2) 이행성
3) 일관성

2. R의 “gemtc” 패키지를 이용한 베이지안 네트워크 메타분석
2.1. 이분형(binary data) 예제자료
1) 데이터 코딩 및 불러오기
2) 네트워크 셋업
3) 네트워크 모델
4) MCMC 시뮬레이션과 수렴여부 진단
5) 일관성 검정(inconsistency test)
6) 숲그림(forest plot)
7) 치료간 비교우위 선정(treatment ranking)
2.2. 연속형(continuous data) 예제자료
1) 데이터 코딩 및 불러오기
2) 네트워크 셋업
3) 네트워크 모델
4) MCMC 시뮬레이션과 수렴여부 진단
5) 일관성 검정(inconsistency test)
6) 숲그림(forest plot)
7) 치료간 비교우위 선정(treatment ranking)

3. R의 “netmeta” 패키지를 이용한 빈도주의 네트워크 메타분석
3.1. 이분형(binary data) 예제자료
1) 데이터 코딩 및 불러오기
2) 네트워크 모델
3) 일관성 검정(inconsistency test)
4) 숲그림(forest plot)
5) 치료간 비교우위 선정(treatment ranking)
3.2. 연속형(continuous data) 예제자료
1) 데이터 코딩 및 불러오기
2) 네트워크 모델
3) 일관성 검정(inconsistency test)
4) 숲그림(forest plot)
5) 치료간 비교우위 선정(treatment ranking)

4. 베이지안 vs 빈도주의 방법 그리고 R vs STATA 소프트웨어에따른 네트워크 메타분석 결과 비교
4.1. 효과크기 비교
4.2. 일관성 검정결과 비교
4.3. 치료간 비교우위 선정 비교

참고문헌

Appendix. R 네트워크 메타분석 코드
▶ 베이지안 방법 “gemtc” 패키지_이분형자료
▶ 베이지안 방법 “gemtc” 패키지_연속형자료
▶ 빈도주의 방법 “netmeta” 패키지_이분형자료
▶ 빈도주의 방법 “netmeta” 패키지_연속형자료

『이젠 R아야 한다』시리즈를 기획하게 된 동기는 무료이면서도 강력한 통계기능들을 수행할 수 있는 R을 더 이상 외면할 수 없었기 때문이며 누구나 쉽게 메타분석에 접근하도록 도움을 주고자 하는 저자의 연구사명과도 일치한다.

물론 저자가 생각하는 가장 최적의 메타분석 소프트웨어는 STATA이다. 아마도 STATA와 R 소프트웨어를 경험한 연구자라면 누구나 쉽게 동의할 것이다. 예를 들어 동일한 메타분석을 수행하더라도 STATA에서는 단 한 줄의 명령어가 R에서는 명령어 문법을 이해해야 하며 여러 줄로 나누어야 한다. 그러나 무료이면서 강력한 통계기능은 충분히 이런 번거로움을 감내할 만하다.
STATA를 이용한 네트워크 메타분석 책 [메타분석 (forest plot에서 네트워크 메타분석까지) 황성동·심성률 (2018) 한나래출판사] 출판 이후로 많은 독자분들의 베이지안 방법 적용에 대한 문의가 있었다. 기존 STATA에서 베이지안(Bayes) 네트워크 메타분석을 이용하기 위해서는 소스 코드를 이용하여 프로그래밍을 해야하며 이것은 통계분석과 컴퓨터 언어 학습의 주객이 뒤바뀌는 매우 불편한 현실이었다.
따라서 저자는 베이지안 방법과 빈도주의 방법이 모두 적용가능한 통계프로그램으로서 R을 이용하였으며 기존의 STATA 분석결과와 비교도 제시하였다.
R을 이용하기 위해서는 기본적으로 R의 언어를 이해하여야 한다. 그러나 통계분석용으로서의 R은 기초적인 패키지 사용과 데이터 및 함수 설정 방법 정도만 익힌다면 누구라도 쉽게 이용할 수 있다. 더욱이 R studio를 같이 설치한다면 그래픽 사용자 입력방식을 지원하기에 매우 편리하다.
본서를 활용할 때 맨 마지막 부록의 R코드를 복사해서 R프로그램에서 그대로 붙인 다음 실행해 볼 것을 저자는 매우 권고한다. R에 대한 이해가 전혀 없더라도 막상 도출되는 결과가 눈에 보인다면 그때부터 본문의 내용을 따라가면서 하나씩 해석하면 될 것이다.

『이젠 R아야 한다』 메타분석 시리즈는 저자 심성률 박사가 그동안 출판한 국내 연구자들을 위한 메타분석 방법론들을 묶어서 R 소프트웨어로 다시 풀어낸 것이다.

통계프로그램으로서의 R이 대세인 연구환경에서 R을 활용한 체계적인 메타분석 안내서가 요구되어지며 본서가 이에 대한 좋은 해답이 될 것임을 확신한다.
더욱이 R을 활용하여 기본적인 중재 메타분석 뿐만 아니라 Special topic인 네트워크 메타분석, 진단검사 메타분석, 용량-반응 메타분석 등을 상세히 안내하는 『이젠 R아야 한다』 메타분석 시리즈는 본서가 유일하다.
이론과 더불어 실습위주의 내용으로 이루어져 있어 통계학을 전공하지 않은 국내연구자들이 쉽고 빠르게 응용할 수 있을 것이다. 단계별로 예제를 따라가다보면 복잡하고 어려웠던 메타분석의 결과물이 도출되어져 있을 것이다.
마지막으로 본서는 가격적인 측면에서 상업용 책이라고 보기에는 민망하다. 그저 저자의 연구사명대로 누구나 쉽게 메타분석에 접근하도록 도움을 주고자하는 노력의 일환으로 바라봐 주기 바란다.

작가정보

저자(글) 심성률

저자 심성률은 고려대학교에서 역학 및 의료정보학을 전공하여 보건학 박사학위를 받았다(M.P.H. & PH.D.). 식품의약품 안전처와 식품의약품 안전평가원에서 메타분석과 위해도 평가 자문위원을 역임했다. 서울대학교 외 여러 기관에서 통계학(메타분석) 특강을 진행했으며 주요 SCI(E) 저널 논문 심사위원을 지냈다. 현재 고려대학교 의과대학 예방의학교실 겸임교수 및 순천향대학교 서울병원 비뇨의과학연구소 연구원으로 활동 중이다. 주요 저서로는 『메타분석 (forest plot에서 네트워크 메타분석까지)』 황성동·심성률 (2018) 한나래출판사. 『R 중재 메타분석 (Intervention meta-analysis using R software)』 심성률 (2019) 에스디비연구소(SDB Lab). 『R & Meta-DiSc 진단검사 메타분석 (Diagnostic Test Accuracy using R & Meta-DiSc software)』 심성률 (2019) 에스디비연구소(SDB Lab). 『R 용량-반응 메타분석 (Dose response meta-analysis using R software)』 심성률 (2019) 에스디비연구소(SDB Lab). 『R 네트워크 메타분석 (Network meta-analysis using R software; Bayesian & Frequentist approach)』 심성률 (2019) 에스디비연구소(SDB Lab). 『임상자료와 약물유전체 상관성 검증을 위한 근거기반 메타분석 안내서』 신인수·배종면·심성률 (2017) 식품의약품안전평가원 등이 있다. 주요 논문으로는 SCI(E) paper (약 30편 中 메타분석 16편)와 더불어 국내연구자를 위한 메타분석 방법론 5편 『중재 메타분석을 위한 STATA 명령어』 Journal of Health Informatics and Statistics. 『STATA를 이용한 진단검사 정확도 메타분석』 보건정보통계학회지. 『STATA 명령문을 이용한 용량-반응 메타분석』 Journal of Health Informatics and Statistics. 『네트워크 메타분석: STATA를 활용한 적용과 실제』 Epidemiology and Health. 『유전체 연관 환자-대조군 연구의 메타분석: 적용과 실제』 Epidemiology and Health. 『Efficacy and safety of prostatic arterial embolization: Systematic review with meta-analysis and meta-regression』 Journal of Urology. 『Diagnostic performance of PET in thyroid cancer with elevated anti-Tg Ab』 Endocrine-Related Cancer 등이 있다.

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